L'Inea è presente sul territorio nazionale con 20 Sedi Regionali che svolgono le seguenti attività tecnico-scientifiche:
• attività di consulenza, assistenza tecnica e informazione in favore delle amministrazioni regionali e locali;
• gestione e coordinamento, a livello territoriale, dell'attività di rilevazione dell'indagine RICA-REA;
• attività di ricerca e indagini attraverso l'elaborazione di propri progetti e/o la partecipazione a progetti promossi da altri Enti.
Ogni Sede Regionale partecipa, in attuazione delle linee di indirizzo definite nel piano triennale, alle attività tecniche e scientifiche promosse dalla Sede Centrale.

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