L'INEA svolge attività di ricerca, di rilevazione, analisi e previsione nel campo strutturale e socio-economico del settore agro-industriale, forestale e della pesca. Negli ultimi anni l'attività dell'Istituto si è ampliata nelle attività di supporto alla Pubblica Amministrazione per l'attuazione delle politiche agricole, in primo luogo quelle che discendono dall'Unione Europea.

L'INEA è coinvolto dai servizi della Commissione Europea, dal Ministero per le Politiche Agricole, Alimentari e Forestali e da numerose regioni in attività di assistenza tecnica, monitoraggio e valutazione delle politiche di sostegno al settore agricolo e di sviluppo rurale.

Filoni recenti di attività vedono l'Istituto impegnato su temi riguardanti la valorizzazione delle risorse ambientali e la gestione delle risorse idriche.

L'Istituto è articolato in due Uffici dirigenziali e in 20 sedi regionali:

Ufficio dirigenziale amministrativo
L'ufficio, la cui titolarità è affidata alla Dott.ssa Silvia Incoronato, è articolato in 4 Servizi:

• Servizio A
Provvedimenti ed affari generali

• Servizio B
Risorse umane e personale

• Servizio C
Contabilità e bilancio

• Servizio D
Atti contrattuali

Ufficio dei Servizi Tecnici e della Ricerca
L'ufficio, la cui titolarità è affidata alla Dott.ssa Laura Proietti, è articolato in 5 Servizi:

• Servizio 1
Rilevazioni contabili e ricerche (analisi) microeconomiche.

• Servizio 2
Ricerche macroeconomiche e congiunturali.

• Servizio 3
Ricerche strutturali, territoriali e servizi di sviluppo agricolo.

• Servizio 4
Ricerche su ambiente ed uso delle risorse naturali in agricoltura.

• Servizio 5
Biblioteca, editoria e rete telematica.